古神翼龙属于稀有飞行生物，主要出没于孤岛的高空区域，全地图都可能遇到但数量极少，通常同时存在的个体不超过三到五只。寻找时最好携带望远镜，站在高处扫视天空，一旦发现其盘旋的轨迹就追。由于古神翼龙警觉性极高飞行速度较快，靠近时容易被察觉并逃离。驯服前需要准备足够的麻醉箭或麻醉镖，以及流星锤和优质肉类。靠近目标后先观察地形，尽量将其引至山谷或密林等狭窄区域，利用障碍物限制飞行路径。
此时可以借助已驯服的飞行生物进行空中围堵，例如使用翼龙跟随干扰，迫使古神翼龙降低高度或改变方向。当距离缩短至二十米左右，迅速投掷流星锤将其短暂定身，随后用麻醉箭连续射击头部或躯体，优先提升眩晕值。注意麻醉效率要足够，否则目标可能在中途苏醒逃脱。古神翼龙被击晕后，需尽快将优质生肉或饲料放入其背包，等待驯养进度完成。过程中要随时补充麻醉药或黑果子以维持眩晕状态，避免驯服失败。
驯养后的古神翼龙具备独特的机动能力，例如垂直起降和空中悬停，适合在复杂地形中快速移动。按住特定按键可触发原地旋转动作，便于调整飞行角度或躲避攻击。此外其抓取功能允许携带小型生物，例如渡渡鸟或中猴。日常使用中古神翼龙的负重与耐力属性需要优先提升，长途飞行时可搭配耐力回复食物延长续航。遭遇敌对生物时，利用俯冲加速和急转摆脱追击，或抓取敌方小型单位投掷至远处。驯养后的古神翼龙主要依赖机动性实现战术目标，例如侦查资源点或快速撤离危险区域。